MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 plasmid pMLa

Total Repeats: 5819

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_002679	GAC	2	6	99818	99823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488076
1502	NC_002679	TTGT	2	8	99832	99839	0 %	75 %	25 %	0 %	13488076
1503	NC_002679	TCA	2	6	99865	99870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488076
1504	NC_002679	TCC	2	6	99970	99975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488076
1505	NC_002679	CTT	2	6	99977	99982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488076
1506	NC_002679	CGT	2	6	99984	99989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488076
1507	NC_002679	AAG	2	6	100023	100028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488076
1508	NC_002679	TGC	2	6	100105	100110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488076
1509	NC_002679	CCTG	2	8	100168	100175	0 %	25 %	25 %	50 %	13488076
1510	NC_002679	GCGA	2	8	100199	100206	25 %	0 %	50 %	25 %	13488076
1511	NC_002679	AAG	2	6	100255	100260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488076
1512	NC_002679	CAT	2	6	100313	100318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488076
1513	NC_002679	GC	3	6	100366	100371	0 %	0 %	50 %	50 %	13488076
1514	NC_002679	TCGT	2	8	100377	100384	0 %	50 %	25 %	25 %	13488076
1515	NC_002679	GGT	2	6	100390	100395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488076
1516	NC_002679	AAC	2	6	100443	100448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488076
1517	NC_002679	CCA	2	6	100541	100546	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488076
1518	NC_002679	T	7	7	100553	100559	0 %	100 %	0 %	0 %	13488076
1519	NC_002679	GTC	2	6	100588	100593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488076
1520	NC_002679	CAA	2	6	100604	100609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488076
1521	NC_002679	TGT	2	6	100704	100709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488076
1522	NC_002679	ATG	2	6	100779	100784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488076
1523	NC_002679	GCC	2	6	100785	100790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488076
1524	NC_002679	TCG	2	6	101999	102004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1525	NC_002679	AC	3	6	102013	102018	50 %	0 %	0 %	50 %	13488222
1526	NC_002679	GCG	2	6	102037	102042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488222
1527	NC_002679	AC	3	6	102046	102051	50 %	0 %	0 %	50 %	13488222
1528	NC_002679	GGA	2	6	102072	102077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488222
1529	NC_002679	TGA	2	6	102180	102185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488222
1530	NC_002679	CGC	2	6	102197	102202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488222
1531	NC_002679	CAG	2	6	102212	102217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1532	NC_002679	TTC	2	6	102256	102261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488222
1533	NC_002679	CGT	2	6	102362	102367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1534	NC_002679	TGT	2	6	102407	102412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488222
1535	NC_002679	CGAA	2	8	102426	102433	50 %	0 %	25 %	25 %	13488222
1536	NC_002679	GCC	2	6	102448	102453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488222
1537	NC_002679	GAC	2	6	102466	102471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1538	NC_002679	TGC	2	6	102518	102523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1539	NC_002679	GA	3	6	102644	102649	50 %	0 %	50 %	0 %	13488222
1540	NC_002679	TAG	2	6	102699	102704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488222
1541	NC_002679	GCG	2	6	102727	102732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488222
1542	NC_002679	CA	3	6	102766	102771	50 %	0 %	0 %	50 %	13488222
1543	NC_002679	ACG	2	6	102791	102796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1544	NC_002679	AGCG	2	8	102825	102832	25 %	0 %	50 %	25 %	13488222
1545	NC_002679	CAT	2	6	102847	102852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488222
1546	NC_002679	CAT	2	6	102984	102989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488222
1547	NC_002679	ATC	2	6	103034	103039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488222
1548	NC_002679	CGG	2	6	103072	103077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488222
1549	NC_002679	CGA	2	6	103101	103106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1550	NC_002679	GGC	2	6	103254	103259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488222
1551	NC_002679	CCT	2	6	103311	103316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488222
1552	NC_002679	GAC	2	6	103321	103326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1553	NC_002679	TGGC	2	8	103339	103346	0 %	25 %	50 %	25 %	13488222
1554	NC_002679	GCA	2	6	103414	103419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1555	NC_002679	TCC	2	6	103421	103426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488222
1556	NC_002679	AG	3	6	103452	103457	50 %	0 %	50 %	0 %	13488222
1557	NC_002679	GCC	2	6	103465	103470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488222
1558	NC_002679	CGT	2	6	103476	103481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488222
1559	NC_002679	ACT	2	6	103590	103595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488223
1560	NC_002679	CGT	2	6	103698	103703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1561	NC_002679	CT	3	6	103774	103779	0 %	50 %	0 %	50 %	13488223
1562	NC_002679	GAC	2	6	103900	103905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1563	NC_002679	GCGCCT	2	12	103928	103939	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	13488223
1564	NC_002679	GCG	2	6	103955	103960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488223
1565	NC_002679	CGA	2	6	103980	103985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1566	NC_002679	TCG	2	6	104049	104054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1567	NC_002679	CA	3	6	104209	104214	50 %	0 %	0 %	50 %	13488223
1568	NC_002679	ATT	2	6	104218	104223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13488223
1569	NC_002679	GT	3	6	104260	104265	0 %	50 %	50 %	0 %	13488223
1570	NC_002679	ACG	2	6	104301	104306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1571	NC_002679	CTT	2	6	104348	104353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488223
1572	NC_002679	TG	3	6	104388	104393	0 %	50 %	50 %	0 %	13488223
1573	NC_002679	GCA	2	6	104462	104467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488223
1574	NC_002679	CGAT	2	8	104484	104491	25 %	25 %	25 %	25 %	13488223
1575	NC_002679	GGC	2	6	104574	104579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488223
1576	NC_002679	GGC	2	6	104599	104604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488223
1577	NC_002679	AGCC	2	8	105808	105815	25 %	0 %	25 %	50 %	13488352
1578	NC_002679	GCTG	2	8	105866	105873	0 %	25 %	50 %	25 %	13488352
1579	NC_002679	CG	3	6	105900	105905	0 %	0 %	50 %	50 %	13488352
1580	NC_002679	CATGC	2	10	105999	106008	20 %	20 %	20 %	40 %	13488224
1581	NC_002679	CGA	2	6	106051	106056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1582	NC_002679	GGA	2	6	106079	106084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1583	NC_002679	GCG	2	6	106092	106097	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1584	NC_002679	CGAAGC	2	12	106144	106155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1585	NC_002679	CG	3	6	106196	106201	0 %	0 %	50 %	50 %	13488224
1586	NC_002679	CTG	2	6	106263	106268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1587	NC_002679	GAG	3	9	106314	106322	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1588	NC_002679	CGA	2	6	106354	106359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1589	NC_002679	AAG	2	6	106404	106409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13488224
1590	NC_002679	CGG	2	6	106431	106436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1591	NC_002679	GCA	2	6	106483	106488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1592	NC_002679	CAA	2	6	106700	106705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488224
1593	NC_002679	ACTC	2	8	106742	106749	25 %	25 %	0 %	50 %	13488224
1594	NC_002679	GGC	3	9	106847	106855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1595	NC_002679	CTT	2	6	106901	106906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488224
1596	NC_002679	GCTG	2	8	106922	106929	0 %	25 %	50 %	25 %	13488224
1597	NC_002679	ATC	2	6	106966	106971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488224
1598	NC_002679	CGC	2	6	106972	106977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488224
1599	NC_002679	GCT	2	6	107072	107077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1600	NC_002679	GGA	2	6	107078	107083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1601	NC_002679	GGC	2	6	107108	107113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488224
1602	NC_002679	GCTG	2	8	107114	107121	0 %	25 %	50 %	25 %	13488224
1603	NC_002679	AGCC	2	8	107177	107184	25 %	0 %	25 %	50 %	13488224
1604	NC_002679	CCCA	2	8	107321	107328	25 %	0 %	0 %	75 %	13488224
1605	NC_002679	CTC	2	6	107329	107334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488224
1606	NC_002679	GAAGCC	2	12	107360	107371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1607	NC_002679	GGA	2	6	107444	107449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1608	NC_002679	GAG	2	6	107481	107486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13488224
1609	NC_002679	TG	3	6	107488	107493	0 %	50 %	50 %	0 %	13488224
1610	NC_002679	TCG	2	6	107606	107611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1611	NC_002679	CG	3	6	107626	107631	0 %	0 %	50 %	50 %	13488224
1612	NC_002679	TCG	2	6	107719	107724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488224
1613	NC_002679	ACA	2	6	107801	107806	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488224
1614	NC_002679	GCC	2	6	107836	107841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488224
1615	NC_002679	CGA	2	6	108822	108827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
1616	NC_002679	CCA	2	6	108879	108884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
1617	NC_002679	TGT	2	6	108910	108915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13488077
1618	NC_002679	GTG	2	6	108962	108967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488077
1619	NC_002679	TTC	2	6	109042	109047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13488077
1620	NC_002679	ACC	2	6	109081	109086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
1621	NC_002679	CGA	2	6	109149	109154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488077
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1623	NC_002679	CAC	2	6	109237	109242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13488077
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1746	NC_002679	CGG	2	6	114737	114742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488082
1747	NC_002679	GCA	3	9	114758	114766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488082
1748	NC_002679	TCA	2	6	114824	114829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488082
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1750	NC_002679	GGT	2	6	114876	114881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488082
1751	NC_002679	GCA	2	6	114893	114898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488082
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1754	NC_002679	GTC	2	6	115101	115106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488082
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1761	NC_002679	TGC	2	6	115605	115610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488083
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1861	NC_002679	CGAG	2	8	121345	121352	25 %	0 %	50 %	25 %	13488085
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1872	NC_002679	CGA	2	6	123038	123043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13488086
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1884	NC_002679	CCT	2	6	123549	123554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488087
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1990	NC_002679	GCC	2	6	129614	129619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13488093
1991	NC_002679	TGA	2	6	129751	129756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13488093
1992	NC_002679	TCG	2	6	129831	129836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13488093
1993	NC_002679	CGG	2	6	129838	129843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13488093
1994	NC_002679	GGT	2	6	129944	129949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13488093
1995	NC_002679	CAT	2	6	129961	129966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488093
1996	NC_002679	ACA	2	6	129990	129995	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13488093
1997	NC_002679	TCA	2	6	130240	130245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13488093
1998	NC_002679	CG	3	6	130455	130460	0 %	0 %	50 %	50 %	13488094
1999	NC_002679	GCGA	2	8	130496	130503	25 %	0 %	50 %	25 %	13488094
2000	NC_002679	CCT	2	6	130544	130549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13488094

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